La GFP (green fluorescent protein) è un polipeptide, tipico di alghe marine e meduse, che rende fluorescente l’organismo che la possiede.
Il gene d’interesse che codifica per tale proteina deve dunque essere necessariamente presente nel plasmide.
La sequenza ORI è costituita da alcuni nucleotidi il cui compito è quello di dare il segnale d’inizio per la sintesi della GFP. L’AraC è un gene di regolazione; esso codifica, cioè, per particolari proteine di regolazione dette repressori, che favoriscono oppure bloccano la trascrizione di RNA messaggero. Quando nel terreno di coltura è presente l’arabinosio (uno zucchero), che funge da induttore, questo si lega al repressore che si trova attaccato ad un particolare sito della molecola di DNA detto operatore, e lo stacca, permettendo all’RNA polimerasi di iniziare il suo lavoro.
E’ necessario inoltre aggiungere un gene per la resistenza agli antibiotici perché, una volta terminato il procedimento, le colture di batteri vengono posti in una soluzione in cui è presente ampicillina ed il tutto viene posto in una stufetta. I batteri che sopravviveranno a quest’ultimo passaggio, saranno quelli che avranno ricevuto il plasmide.